Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21411J3KMS0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms