Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M1F7CXU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-M1F7CXU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms