Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms