Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Igkv1-99F6XWB2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms