Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc71lE9Q4T4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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