Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc175E9PVB3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms