Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3543D3Z235 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm3543D3Z235 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm3543D3Z235 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3543D3Z235 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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