Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CatipB9EKE5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CatipB9EKE5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms