Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apol6B7ZC55 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Apol6B7ZC55 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms