Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU015836B2RUM3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms