Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3aB1AWZ3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms