Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA3AA6NCI4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms