Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms