Protein–RNA interactions for Protein: A2AE21

Zfp300, Zinc finger protein 300, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp300A2AE21 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zfp300A2AE21 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp300A2AE21 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms