Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms