Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 USP32P1-203ENST00000417524 1014 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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USP35Q9P2H5 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
USP35Q9P2H5 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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