Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr1324-202ENSMUST00000215270 5679 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 D630045J12Rik-201ENSMUST00000117556 10916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm884-202ENSMUST00000167262 4576 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Hoxd11P23813 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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