Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 IGHVII-78-1-201ENST00000521105 269 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL022318.4-202ENST00000622217 591 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 IL5RA-202ENST00000311981 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TRIM51EP-201ENST00000524374 1516 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEPT4-216ENST00000580844 1396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TGIF2LY-201ENST00000321217 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-205ENST00000368389 543 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RPS28P8-201ENST00000435020 208 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL441963.1-201ENST00000435137 792 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL035417.1-201ENST00000442754 214 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL451081.2-201ENST00000448115 933 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC117422.1-201ENST00000508263 379 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CFAP52-208ENST00000576499 711 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 KAT14-206ENST00000489634 3152 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ST7-213ENST00000432298 1956 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AMZ2-205ENST00000577866 1492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
CSPP1Q1MSJ5 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms