Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PoleQ9WVF7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PoleQ9WVF7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms