Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec2Q9WV35 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apobec2Q9WV35 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms