Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PplQ9R269 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PplQ9R269 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms