Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms