Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf10bQ9QZM4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms