Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copg1Q9QZE5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg1Q9QZE5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms