Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Bcl11aQ9QYE3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bcl11aQ9QYE3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bcl11aQ9QYE3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms