Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Kcnip3Q9QXT8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Kcnip3Q9QXT8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Kcnip3Q9QXT8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Kcnip3Q9QXT8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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