Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Homer2Q9QWW1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms