Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dnaja4Q9JMC3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnaja4Q9JMC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms