Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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SacsQ9JLC8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SacsQ9JLC8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SacsQ9JLC8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SacsQ9JLC8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SacsQ9JLC8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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SacsQ9JLC8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SacsQ9JLC8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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