Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms