Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lmbr1Q9JIT0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms