Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Kcnmb4Q9JIN6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kcnmb4Q9JIN6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnmb4Q9JIN6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnmb4Q9JIN6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Kcnmb4Q9JIN6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Kcnmb4Q9JIN6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Kcnmb4Q9JIN6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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