Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn12Q9ET43 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms