Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snap29Q9ERB0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snap29Q9ERB0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms