Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ap3s1Q9DCR2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms