Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tspan4Q9DCK3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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