Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

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Length 74 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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MNCb-2875Q9DCB3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
MNCb-2875Q9DCB3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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