Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmg20aQ9DC33 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hmg20aQ9DC33 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hmg20aQ9DC33 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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