Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn9Q9D805 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capn9Q9D805 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms