Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa5Q9D7I0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa5Q9D7I0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms