Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D4W2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D4W2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms