Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syce1Q9D495 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms