Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933421I07RikQ9D420 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms