Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms