Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms