Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChtopQ9CY57 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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