Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nip7Q9CXK8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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