Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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