Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc43Q9CR29 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc43Q9CR29 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc43Q9CR29 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc43Q9CR29 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms