Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mri1Q9CQT1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mri1Q9CQT1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms